Simon vs A Agenda Homo Sapiens vai constar a história do Simon, um jovem de 16 anos que é gay, mas ninguém sabe disso. Até que em um tumblr de fofocas da escola alguém se assume gay anonimamente (não sei se isso faz sentido) e Simon entra em contato anonimamente com essa pessoa, que usa o pseudônimo de Blue. E eles começam a trocar e-mails.
Até que um dia, Simon acaba deixando seu e-mail logado no computador da escola e o Martin lê os e-mails entre Simon e Blue, dá print e começa a chantagear o Simon, pedindo para ele ajudá-lo a ficar com a Abby, uma das melhore amigas de Simon. E ele fica nesse dilema, porque não quer que os e-mails vazem, mas ao mesmo tempo não quer ajudar o babaca do Martin. O que fazer?